Von alleine dürfte ein Mods-ordner bei RA nicht entstehen. Den musst du selbst erst anlegen für die Downloads. Am einfachsten deinen Mods-Ordner aus dem Hauptspiel ausschneiden und im Hauptverzeichnis bei RA einfügen. Analog die Ressource.cfg ausschneiden in in den Hauptordner von RA packen. Die d3dxdll ebenfalls rausschneiden aus dem Bin-Ordner des Hauptspiels in den von RA.
Hier mal mit ein paar Bildern.
http://www.simforum.de/showpost.php?p=3726325&postcount=193
Dass das Spiel nicht startet könnte an inkompatiblen Mods liegen. Daher würde ich empfehlen mal den Mods-Ordner bevor du ihn nach RA rüberschiebst ganz rauszunehmen, z.B. auf deinen Desktop, und dann zu starten. Falls es dann klappt liegt es an einem inkompatiblen Download.
Welchen Patch hast du denn durchgeführt genau? Hast du RA auch installiert und dann gepatch oder was hast du genau getan?